אגף ההנדסה במודיעין עילית עומד בפני אתגרים רבים. העיר נבנתה על קרקע פרטית על ידי יזמים פרטיים ללא מעורבות ממשלתית כגון משרד השיכון, ואופיינה בתכנון ראשוני חסר. אישור התב"עות נעשה ביוזמת היזמים עוד בטרם הקמת העיר על ידי מועצת תכנון עליונה בבית אל, שהינה הגוף המאשר באזור. במסגרת התב"עות לא יועדו כלל שטחים לתעשייה, תעסוקה, תחבורה, חרום וביטחון. כמו כן לא הופרשו מספיק שטחים המיועדים למבני ציבור, שצ"פים ומסחר
קושי נוסף איתו מתמודד אגף ההנדסה הינו המבנה הטופוגרפי של העיר. העיר בנויה על קרקע סלעית, ומורכבת ממספר גבעות. אתגר זה דורש פתרונות הנדסיים סבוכים ועלויות גבוהות
לאגף ההנדסה מסופח צוות של עובדי מינהל הנדסה הבודקים ומאשרים תכניות של מים, ביוב, חשמל, בזק, גז ומערכת הכבישים העירונית
במודיעין עילית 5 שכונות מרכזיות
קרית ספר – תב"עות 210/9/1, 210/9/4א, 210/9/4ב, , 210/9/1/10 ,210/9/4/1
אחוזת ברכפלד – תב"עות 210/6/1, 210/6/2, 210/6/8, 210/6/4, 210/6/9, 210/6/10, 210/6/11
נאות הפסגה – תב"עות 210/4/2, 210/4/2/1, 210/4/2/4
גרין פארק-אבי עזרי
קרית אלימלך – תב"ע 210/6/3
מתתיהו מזרח – תב"עות 210/8/1, 210/8/2, 210/8/5
למען רווחת התושבים יזם אגף הנדסה תב"עות כלליות על מנת למקסם את השימוש בקרקע:
תב"ע 210/11 – המאפשרת שימוש בקומות קרקע של מבני מגורים לגנ"י / מעונות יום.
תב"ע 210/12 – המגדילה זכויות למרפסות סוכה.
תב"ע 210/15 – המאפשרת שימוש, בחלק מקומות הקרקע של מבני המגורים בעיר, למסחר.
תב"ע 210/16 – המאפשרת לבנות תוספות בניה על הגג עד 60 מ"ר.
תב"ע 210/17 – המגדילה את אחוזי הבניה במגרשים המיועדים למבני ציבור.